組織結構是流程運作的基本保證。在研發管理中有兩類跨部門團隊，一個是集成產品管理團隊（IPMT），屬 於高層管理決策層；另一個是產品開發團隊（PDT），屬於項目執行層。
IPMT 和 PDT 都是由跨職能部門的人組成，包含了開發、市場、生產、採購、財務、製造、技術支援等不同部 門的人員，其人員層次和工作重點都有所不同。IPMT 由公司決策層人員組成，其工作是確保公司在市場上有 正確的產品定位，保證項目保證資源、控制投資。
IPMT 同時管理多個 PDT，並從市場的角度考察他們是否盈利，適時終止前景不好的項目，保證將公司有限的 資源投到高回報的項目上。
PDT 是具體的產品開發團隊，其工作是制定具體產品策略和業務計劃，按照項目計劃執行並保證及時完成， 確保小組將按計劃及時地將產品投放到市場。
PDT 是一個虛擬的組織，其成員在產品開發期間一起工作，由項目經理組織，可以是項目經理負責的項目單 列式組織結構。
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