荷魯斯之亂
在大遠征的鼎盛時期，受到混沌蠱惑的戰帥荷魯斯忽然率領一半的星際戰士軍團發動叛亂，在伊斯塔萬三號三支忠誠軍團遭到了叛徒們的突然襲擊損失慘重。
伊斯萬塔三號戰鬥
數百個世界以混沌之神的名義燃燒，在伊斯塔萬系統的首次戰鬥之後，銀河上爆發了一場前所未有的恐怖叛亂。
巨人們以雷鳴般的速度吞食著銀河，戰火燃燒，星球爆裂。這些叛亂時代的大部分真相已經消失了，被時間的迷霧所掩蓋或篡改。
荷魯斯的叛徒們一路獲勝，將戰火蔓延至人類帝國的中心神聖泰拉，但絕望的時代自然會有不懼犧牲的英雄出現。聖吉列斯率領的聖血天使和多恩率領的帝國之拳保衛著帝皇神殿，帝皇與荷魯斯到了決戰的時刻。
聖吉列斯對決荷魯斯
在這場決定人類帝國命運戰鬥中，聖吉列斯為了保護帝皇被荷魯斯殘忍殺害，荷魯斯充毀滅性的混沌力量對皇帝造成了致命的打擊，但最終，皇帝的意志更強大，他拖著劇痛的身軀將荷魯斯的肉體和靈魂徹底摧毀，而隨著他的死，叛徒軍團的叛亂也宣佈失敗了。
帝皇與荷魯斯
當多恩和他的戰士們最終趕到時，他們發現了奄奄一息的帝皇還有已經犧牲的聖吉列斯，多恩的哀嚎聲據說響徹整個泰拉。
羅加爾•多恩是堅毅的基因原體，在帝皇的指引下，他將帝皇的身軀放在了擁有靜滯力場的黃金王座上，只有保持現狀才能維持帝皇的生命，人類之神在人間行走的時代結束了。
叛徒被擊敗了，但是人類帝國付出了巨大的犧牲，大遠征無力繼續，帝皇對帝國和全人類的願景也破滅了，人類新的黃金時代永遠消失了。
沉重的代價
皇帝造就的人類帝國幾乎被摧毀，銀河中分散了不知多少叛軍，經過了數十年的大清洗，才將叛徒們都趕到了恐懼之眼裡。
死亡人數高達數十億，無數的世界只剩下荒地，儘管撲滅了戰火，人類帝國還是處於瀕臨滅絕的岌岌可危境地。
聖血天使泰拉保衛戰
混沌的陰險力量已經能夠使荷魯斯和許多星際戰士反抗皇帝。那麼以後就不會嗎蠱惑別人嗎？
荷魯斯被擊敗後，極限戰士的基因原體羅伯特基裡曼暫時主政帝國，他決定調整星際戰士軍團的結構，以免再次發生類似的災難。
阿斯塔特聖典與二次建軍
因為相關材料的丟失，荷魯斯之亂後新成立了多少戰團不得而知，只是大概知道帝國中散佈著一千多個戰團
荷魯斯之亂後，帝國進入了內部調整的時期，基裡曼設計好了帝國中央政務院的結構，並限定了行星總督的責任和義務。然後就開始了對於軍隊的整編。
羅伯特·基裡曼
星際戰士軍團被縮減成戰團，其餘的人組成一系列另外命名的子團。這一重要事件被稱為“ 二次建軍”，此後的一千年中又發生了二十多起整編。
這幾乎是由基裡曼一手進行的，他以帝國指揮官的身份調整了星界軍、帝國海軍還有星際戰士的軍隊結構。
他將他無人出其右的治理能力凝練成“阿斯塔特聖典”，這是帝國時代未來的基礎。，其中詳細描述了軍隊的戰術角色，設備規格，統一標記，命令協議以及無數其他方面的規定。其中最重要的就是將現有的星際戰士軍團拆散並重組為較小的戰團。
儘管他的許多原體兄弟最初都反對基裡曼的法令，但幾乎所有人最終都理解了為了帝國安全而進行重組的必要性。
聖典
除了自己的名稱和紋章外，這些新戰團中的每一個都應設立一個家園世界或堡壘修道院，並將其用作防禦帝國免受所有威脅的堡壘。
《阿斯塔特聖典》指出，每個戰團將由一千名星際戰士組成，並自己負責招募，訓練和裝備。任何一個人都無法控制幾萬星際戰士的強大力量了。
內戰中還暴露了幾個星際戰士軍團的基因種子的缺陷之處。這些缺陷隨著代際遺傳逐漸加劇，聖典主要目標之一就是認識並消除這些遺傳弱點。聖典規定星際戰士應該永遠保持修行和鍛鍊，而基因種子的純度也應該受到更嚴格的檢驗。
作為最後的保障措施，基裡曼責成泰拉政務院建立維護基因種子庫，以生產和存儲十分之一的基因種子。為了防止交叉汙染，每個軍團的基因種子都被隔離保存，而叛徒軍團的基因庫被放置在靜置力場中封印不被啟用。
通過直接控制這些基因庫，泰拉的中央政務院可以有效地控制這些星際戰士戰團。
幾千年來，戰團都嚴格遵守基裡曼的阿斯塔特聖典。這些星際戰士以遵循《阿斯塔特聖典》神聖版中的信條為榮，儘管一些戰團偏離了一些嚴格法令，對聖典的教義進行了獨特的改動，但大體上仍忠於古利曼的基本原則。此外，幾個世紀以來，聖典本身也進行了無數次的重新分析，重新解釋和修改。
少數戰團與完全不遵守聖典規定的戰團結構。其中最著名的是太空野狼。勒曼•魯斯的兒子們從來沒有遵循過阿斯塔特聖典，狼團一直保持著自己獨特的內部結構。
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