根據《財政部 國家稅務總局關於全面推開營業稅改徵增值稅試點的通知》（財稅2016 36號）的規定，自2016年5月1日起營業稅全面改徵增值稅，其他個人出租不動產徵收增值稅。
現行計徵個人出租房屋稅費的方式為兩種：（個人可選擇綜合徵收率計徵方式或分稅種計徵方式計算繳納稅款）
一、 分稅種計徵方式：按照現行各稅種政策規定，分別計算繳納各項稅費。
二、 綜合徵收率計徵方式：
徵收率分為住房與非住房兩種
個人出租住房綜合徵收率為5%。月租金收入在31500元以上的，稅務機關向納稅人填開包括增值稅、房產稅和個人所得稅的完稅證明；月租金收入在31500元（含）以下的，稅務機關征收稅款後，想納稅人填開包括房產稅和個人所得稅的完稅證明。因為月收入小於9萬的免增值稅。
個人出租非住房房屋與租金收入在31500元以上的，綜合徵收率為12%稅務機關向納稅人填開包括增值稅、房產稅和個人所得稅的完稅證明；月租金收入在31500元（含）以下的，綜合徵收率為7%。稅務機關征收稅款後，想納稅人填開包括房產稅和個人所得稅的完稅證明。
說明：
1. 個人出租房屋（住房），按照5%的徵收率減按1.5%計算應納稅額
1) 不含稅銷售額=租金收入/（1+5%）
2) 不含稅銷售額>3萬元，應納稅額=不含稅銷售額*1.5%
3) 不含稅銷售額<=3萬元時，應納稅額=0
2. 個人出租房屋（非住房），按照5%的徵收率計算應納稅額
1) 不含稅銷售額=租金收入/（1+5%）
2) 不含稅銷售額>3萬元，應納稅額=不含稅銷售額*5%
3) 不含稅銷售額<=3萬元時，應納稅額=0
3.按“財產租賃所得”項目計算繳納個人所得稅的具體方法：
每次（月）收入不超過4000元（含）的：應納稅額=[每次（月）收入-准予扣除項800元]*10%
每次（月）收入超過4000元的：應納稅額=[每次（月）收入-准予扣除項]*（1-20%）*10%
准予扣除項目包括：
1) 財產租賃過程中繳納的稅費（不包括本次出租繳納的增值稅）
2)由納稅人負擔的租賃財產實際開支的修繕費用：是指能夠提供有效、準確憑證，證明由納稅義務人負擔的該出租財產實際開支的修繕費用。以每次800元為限，一次扣除不完的，准予在下次繼續扣除，直至扣完為止。
4.如何區分住房和非住房：
按照房本登記的房屋類型進行區分，房本的房屋類型為居住類用房如住宅、公寓的即為住房；其他類型均為非住房。
例如張三出租一套在北京的公寓，月租金為28000元，租期半年，那麼按照兩種不同方法應如何計稅呢？
如果選擇綜合徵收率方式，由於租金<31500元，張三應納稅款=28000*5%=1400元。
如果選擇分稅種方式：
不含稅收入=28000/（1+5%）=26666.67元<30000元，故增值稅及其附加稅=0
個人所得稅=26666.67*（1-20%）*10%=2133.33元
房產稅=26666.67*4%=1066.67元
城鎮土地使用稅=0
採用分稅種計算張三應納稅款=2133.33+1066.67=3200元
例如李四出租一套在北京的商鋪100平米，月租金50000元，那麼按照兩種不同方法應如何計稅呢？
如果選擇綜合徵收率方式，由於租金>31500元，李四應納稅款=50000*12%=6000元
如果選擇分稅種方式：
不含稅收入=50000/（1+5%）=47619.05元
增值稅=47619.05*5%=2380.95元
城建稅=2380.95*7%=166.67元
附加稅=2380.95*（3%+2%）=119.05元
房產稅=47619.05*12%=5714.29元
城鎮土地使用稅=100*30*6/12=1500元
個人所得稅=（47619.05-166.67-119.05-5714.29-1500）*（1-20%）*10%=3209.52元
採用分稅種計算李四應納稅款=2380.95+166.67+119.05+5714.29+1500+3209.52=13909.4元
李四選擇綜合徵收率方式最划算。
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