宜賓市境內河流豐沛，水系眾多，除長江、岷江、金沙江三江穿境而過外，有一級支流南廣河、黃沙河、長寧河、橫江河、箭板河、越溪河、中都河、西寧河，二級支流建武河、半邊橋河、鎮舟河、巡司河、宋江河、紅橋河、綿溪河、古宋河等，大小河流溪流縱橫交錯，密如珠網，多達600餘條。
此外，宜賓市內水庫、湖泊約380座。其中較大的水庫有：宜賓縣解放水庫、翠屏區油房坳、南溪縣馬爾巖水庫、長寧縣四方灘、高縣郝家村水庫等。
較有名氣人工湖泊有：翠屏區雙龍湖、宜賓縣少娥湖、高縣七仙湖、長寧縣三松湖等。
長江宜賓段
金沙江從西南向東，岷江從西北向東南，在翠屏區合江門匯合而成長江，故此宜賓有“長江首城”的美譽。長江東流，經南岸、白沙灣、南廣、李莊、宋家，南溪區石鼓、羅龍、馬家、南溪鎮、江南，長寧縣下長，江安縣桐梓、江安鎮、濫壩、怡樂、井口等地，在江安縣的金山寺（這也是宜賓市的海拔最低點236.3米）流入瀘州市的納溪區。
長江在宜賓境內流程83.3千米。沿江多為丘陵，南溪區羅龍鎮金雞以上為深丘，耕地較少，植被較好，河道彎曲，河面僅400—800米；南溪以下，北岸為淺丘，南岸為中丘，耕地多，河面開闊，最寬處達1900米。氣候溫和，物產較豐，城鎮、工礦區沿江分佈，兩岸人口稠密。
金沙江宜賓段
金沙江正源為沱沱河，玉樹以下至宜賓市的2308千米為金沙江。金沙江從雲南綏江縣的大巖洞流入屏山縣冒水鄉，金沙江宜賓段長122.4千米，區間有8條中小河流匯入。兩岸山勢陡峻，河谷狹窄，灘多水急，河道彎曲。宜賓縣安邊以上河面最窄處僅100-150米，安邊以下河面比較開闊，最寬處為900米。金沙江是國家一類保護魚類中華鱘的產卵地。
岷江宜賓段
岷江是長江上游的重要支流，俗稱“府河”，發源自四川北部的岷山南麓，於宜賓縣泥溪鎮月波入宜賓市，自西北向東南流經古柏、蕨溪、真溪，再沿高場、喜捷與翠屏區思坡鄉分界，經菜壩鎮，至合江門與金沙江匯入長江。
岷江干流全長735千米，樂山以下至宜賓為下游，長約170千米。岷江宜賓段為67.8千米。域內多為低山丘陵區，植被良好，流經市境低山深丘地區，植被較好，黃天壩之中壩以及喜捷、安阜河段比較狹窄，最狹處僅200-300米，而在河道凹岸的河灘或河心洲壩，水面很寬，最寬的火廠壩和太公壩處達2800米。
越溪河
越溪河是岷江下游北岸的一條較大支流，發源於威遠縣的越溪鄉，在宜賓縣合什鎮入境，經觀音、隆興、越溪等鄉鎮，在鄧頭溪流入岷江。市境內流程105.1千米，落差34米。它發源於淺丘，上游河面比較開闊。境內多為深丘，河谷下切較深，比較狹窄，兩岸竹林茂盛，但河床比較平緩。沿河風光秀麗，明人樊曙有《越溪記》詳述。
南廣河
南廣河發源於雲南省威信縣大雪山的北麓和兩省三縣交界的群山中。在珙縣入境，經珙縣石碑鄉、羅渡鄉、孝兒鎮，在高縣文江鎮匯合宋江河，北流至慶符鎮、來複鎮和月江鎮，最後在翠屏區南廣注入長江。幹流全長222千米，市境內長度161.7千米。南廣河流域東南高西北低，流域似彎月形，河流多向北流，支流多在西側。
橫江
橫江故名朱提，又名石門江、關河，金沙江南岸一級支流，為過境河流。全長307千米，其中宜賓境內與宜賓界河段長52千米，天然落差69.5米，橫江河谷狹窄，河床深切，兩岸低山相對高差500—800米，多礁石險灘，兇險的有九龍灘、箭槽、橫樑子、明灘、剪刀彎等，航行困難，同時橫江段也是南方絲綢之路唯一的一段水路。
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