亞特蘭大奧運會結束後的1997年，24歲的鄧亞萍來到清華大學外語系學習。她以英語專業本科生的身份初進清華時，她的英文幾乎是一張白紙……小學三年級都沒念完、連26個英文字母都寫不明白的她，直接跳進中國一流的清華大學，的確是有些讓她為難。所以，領導們才又把她送到了英國本土去深造。經清華大學和國家體育總局批准，1998年初，剛在清華讀了幾個月的鄧亞萍作為交換生被送到英國劍橋大學突擊英語”。 2001年，鄧亞萍取得了清華大學外語系英語學士的文憑。2001年9月，鄧亞萍來到了英國的諾丁漢大學，攻讀中國當代研究專業研究生。是年，她在國際奧委會道德委員會及運動和環境委員會分別擔任職務。2002年12月，鄧亞萍獲得了英國諾丁漢大學中國當代研究專業碩士學位；2003年，鄧亞萍成為北京奧組委市場開發部的一名工作人員。獲得碩士學位後，她又被劍橋大學耶穌學院錄取，5年之後的2008年她拿到了劍橋大學基督學院本地經濟學博士學位。
2010年9月，18次世界冠軍、劍橋博士、申奧大使等燦爛光環映照下風光無限的鄧亞萍在擔任人民日報社副秘書長的同時，被推上即刻搜索總經理寶座。
2010年12月6日，鄧亞萍在母校清華大學畢業生招聘會上說：“當你的個人價值疊加在國家的利益上，你的價值會無限放大。我就是這樣的幸運兒。”現在無論怎麼寫一份述職報告，鄧亞萍的這段IT經理人經歷都將尷尬。可能唯一幸運的是，鄧亞萍曾經這樣闡述過做即刻搜索的意義：“我們(即刻搜索)本身代表的是國家，我們最重要的不是賺錢，而是履行國家職責。”
“鄧亞萍本人是很認真勤奮的人，她把人民搜索當作了重要事業。”“她試圖能夠在最短的時間內融入到互聯網圈子裡，但比較戲劇性的是，鄧亞萍幾次演講時，臺下都有人在笑，因為這個圈子只認你做出了什麼東西。”知情人士表示。比如，鄧亞萍曾經這樣評價過百度：“我們(人民搜索投資方為人民日報社和人民網)本身代表的是國家，最重要的不是賺錢，而是履行國家職責。你不用打敗我們，你應該多幫助我們，多給我們出主意。”
鄧亞萍也親自在高校招聘人才。李興說：“即刻搜索給我們的待遇等各方面都是不差的。”這些待遇包括給不少員工解決北京戶口。
三年之後，“花光了20億元”的傳聞以及她面對公眾質疑的持續沉默，讓鄧亞萍面對很多壓力。鄧亞萍如今飽受爭議，與她兒子的法國國籍有關，由於鄧亞萍的丈夫林志剛常年定居法國，鄧亞萍也把自己的兒子林翰銘入了法國國籍。對於此事，她聲稱丈夫常年生活在法國，兒子也是出生在法國，之所以讓兒子入法國籍，是為了方便解決孩子的教育問題。
2015年12月“鄧亞萍被聘為中國政法大學兼職教授”的消息就像一根刺，刺得不少人心頭難安，有學生公開致信校領導要求作出解釋。校方隨後回應稱，聘請鄧亞萍為體育教學部兼職教授，其主要工作是支持學校高水平乒乓球運動隊的建設發展。但這仍無法平息一些法大師生的憤怒，該校教授楊玉聖自稱“因學校當局未經正常程序而聘任鄧女士為兼職教授”而決定逃離中國政法大學。
從學術背景上來講，鄧亞萍是清華大學外語系英語學士，英國諾丁漢大學中國當代研究專業碩士，劍橋大學基督學院土地經濟學博士。與一些出任兼職教授的明星相比，鄧亞萍的學歷要紮實得多，完全有獲聘大學教授的資格。
既然學歷沒問題，為何對人們如此反感鄧亞萍被聘為兼職教授？除了鄧亞萍因“即刻搜索失敗，敗光20億”導致的公眾形象逆轉，任職程序不透明、職業與專業的巨大落差之外，反感的背後還隱藏著人們對運動員骨子裡的歧視，甚至是對體育的偏見。
2016年6月9日，鄧亞萍宣佈辭去人民日報社副秘書長職務，她將和俞敏洪聯手共同打造國內第一家體育產業創新創業平臺。
2016年11月，乒乓球初代大魔王鄧亞萍曬微博，成為清華大學蘇世民書院的導師。她的微博原文：很榮幸成為清華大學蘇世民學院的導師。向大家隆重介紹一下我的三位學生：來自高盛的喀麥隆小夥Blaise，來自哈佛大學的肯尼亞小夥Rahim，還有來自清華大學的北京姑娘黃成。
2018年4月6日，有媒體曝出鄧亞萍要霸氣復出，要替劉國樑指導國乒復仇日本韓國，未知真假。
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