根據業內調查研究發現，畜禽養殖廢棄物處置模式分種類、分規模、分地域、分生產方式，呈現出一定差異。總的來看，我國推行清潔養殖還需要解決規劃不合理、資源化利用模式選擇不當、養殖者環保意識不足等問題。
從散戶到專業戶，再到規模養殖場，部分地方生產規模的擴大超出了自然消納的能力，由此引發了農業面源汙染。第一次全國汙染源普查公報顯示，畜禽糞便汙染已居農業源汙染之首。作為養殖業大國，畜禽糞汙亟待尋求合理轉化路徑。
例如，畜禽養殖糞汙多可製成有機肥，改善土壤；或者用來發酵，生產沼氣。而採取什麼樣的工藝，專家認為，需要因地制宜，就事論事。
拿地域分別來看，地處東北平原的黑龍江、遼寧等地，適合生物發酵床養殖；地處中部平原的河北、山西等地，配套沼氣池使用率高；地處南方水網區的浙江、福建等地，畜禽養殖汙水深度處理和循環利用的比例較大；地處西南山區的廣西、貴州等地，糞汙主要儲存農用。
由於養殖廢棄物帶來的汙染不容忽視，其資源化價值能夠凸顯經濟和環境雙效益，所以國家和地方一直鼓勵養殖業向清潔生產靠攏。中央環保督查也在全國各地清理“散亂汙”企業，督促養殖場配置環保設施，加強汙染排放控制。
不久前，農業部才剛剛下發了《畜禽養殖廢棄物資源化利用工作考核辦法(試行)》。文件的出臺表明，畜禽養殖廢棄物資源化利用將進一步強化監管和評估工作。考核辦法明確了工作目標和重點任務，確定了考核程序，包括自查評分、實地檢查、第三方評估和綜合評價等。
更早之前，2018年中央一號文件，在關注鄉村振興之際，也提出，要加強農業面源汙染防治，推進畜禽糞汙處理。這是農業綠色改革的重要命題，推動以畜禽糞汙為主的廢棄物能源化、肥料化處置，形成專業化和規模化網絡，勢在必行。
《關於加快推進畜禽養殖廢棄物資源化利用的意見》通過制度，為畜禽養殖業指明瞭方向。業界解析，意見帶來了“一條路徑”、“一個機制”、“兩個重點”和“三大目標”。為了實現，全國畜禽糞汙綜合利用率達75%以上的目標，堅持源頭到末端的全過程管控，健全制度體系，構建多元化循環利用閉環，正在路上。
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