以下内容为《进击的巨人》第三季最新剧情：
《进击的巨人》第三季不再是热血沸腾的与巨人之战，而是为了揭开来自于墙内黑暗的战斗，做为调查兵团最强人类的兵长利威尔，也初次面对让他最为棘手的对手，本来兵长想利用艾尔敏和让假扮的希斯特莉亚与艾伦引出他们背后真正的敌人，但是没有想到这个敌人正是兵长的舅舅，也是教会他战斗技巧的师傅凯尼，对于兵长的作战方案可以说了如指掌，其手下也是非常擅长对人作战，以至于能在兵长，三笠以及多位优秀的调查兵团在场的情况之下，从他们身边劫走艾伦和希斯特莉亚。
在巨人第二季结尾，艾伦初次觉醒了始祖巨人的坐标之力，可以控制大量的无垢巨人进行作战，这也使调查兵团离解开巨人的真相更近了一步，这也导致离真相越近调查兵团的处境更加危险，为了能顺利找出真相，韩吉和兵长终于从中央宪兵队成员的铁嘴中套出这个国家王的秘密，原来墙内真正的王是来自于雷伊斯家族。
韩吉还通过艾伦回想起的尤弥尔与贝尔托特的对话内容，发现了继承智慧巨人之力的秘密，虽然无垢巨人在吃掉人类之后不能恢复原貌，但是吞噬含有智慧巨人之力的人类的话结果就完全不一样了，这不但会像尤弥尔一样可以变回人类身躯，还可以继承强大智慧巨人之力，因此韩吉认为，艾伦被中央抓住的结果，很可能会被吃掉，为的就是夺走艾伦体内强大的巨人之力。
而现在那个隐藏在背后的雷伊斯家族的王正是希斯特莉亚的父亲罗德，为什么罗德既要抓走艾伦又要夺回当年舍弃的女儿希斯特莉亚呢？主要原因在于希斯特莉亚体内流淌在王族的血，这便和艾伦体内的始祖巨人之力有关，始祖巨人之力要想真正发挥作用，必须要拥有王族血统才行，那艾伦为什么又能成功使用这个力量呢？这就和吃掉艾伦母亲的那个女巨人有关了，这里就不透露太多剧情了。
虽然团长深知现在调查兵团已经陷入危机之中，但他想到的就是借此机会和皮克西斯司令合作，目的就是为了推翻王政，推举真正的王希斯特莉亚·雷伊斯登上王位，司令最终在听了韩吉带来的情报之后，最终同意了团长的计划，那这个计划最后能否成功呢？
一波未平一波又起，隶属于中央的对人类部队在抓走艾伦和希斯特莉亚之后，凯尼将被兵长说服的商会会长杀害，并利用宪兵将杀害会长的凶手栽赃给了调查兵团，这也让调查兵团失去了民心，调查兵团为此将陷入巨大危机，调查兵团又将何去何从呢