這些年，隨著高校合併，我國出現了很多巨無霸高校，比如“六校合一”的吉林大學，“四校合一”的武漢大學和浙江大學。這些高校合併後，學科趨於齊全，規模也變得龐大，成為綜合性大學排行榜中的大贏家。比如浙江大學，曾經只是理工科院校，如今農學、醫學也是國內首屈一指，綜合排名甚至一度超越北大排名中國高校第二名。
很多人覺得中科大在高校合併大潮中，表現過於低調，導致現在只是靠理科打天下，排名也很尷尬，這種說法有一定的道理，確實，中科大並沒有吃到高校合併的甜頭，但是中科大並不是沒有合併其他高校，中科大其實也曾合併了一所高校。這是唯一併入中國科學技術大學的高校，學生畢業就進“菸草局”，強烈反對被合併。
合肥經濟技術學院，這所高校曾是國家菸草專賣局唯一直屬高校，培養本科層次的學生，學生畢業後面向菸草行業就業，菸草行業那可以算是很好的去向了，所以合肥經濟技術學院在當時也是一所很受考生歡迎的高校，然而後來在高校合併大潮中，這所高校併入了中科大。雖然合肥經濟技術學院也是一所不錯的高校，但是比起中科大，差距還是非常明顯的，所以這兩所高校的“聯姻”，很多人並不看好。
併入中科大後，合肥經濟技術學院的師生們沒佔到什麼便宜，合併後學校就被更名為中國科學技術大學經濟技術學院，學校合併後第二年所有專業就停止了招生。除了菸草科研所這種特色研究機構得以保留，並在此基礎上成立中科大煙草與健康研究中心外，原合肥經濟技術學院的大部分機構都被解散，教師們也大都被分流到菸草系統或者其他行政崗位，繼續留在中科大任教的也有，但是很少。中科大最大的收穫就是拿到了合肥經濟技術學院校區所在的地皮，後來這個校區成為了中科大的南校區，至於其他資源，中科大可能也不需要，也看不上。
中科大合併合肥經濟技術學院，合肥經濟技術學院的學生其實也是不太同意的，畢竟自己本來大學畢業就能進入菸草系統工作，掛個中科大的名還有一種傍大款的感覺，而且即使併入中科大，最後畢業證書和中科大本部的學生也有差異，只是拿到一個所謂中科大經濟技術學院的證書，所以合併其實很不划算。
不管怎樣，大家需要明白這個小知識，那就是中科大歷史上是合併過其他高校的，不要再說中科大自身不願意合併了！
