安徽省的高校，大多起源於本省。但在安徽高校中，有一所高校，不論是誕生，還是前20多年的發展，都是在上海市，是安徽高校中唯一一所起源上海的大學。
他就是安徽醫科大學。安徽醫科大學是安徽省屬重點大學（全省僅4所），培養的醫學人才遍及省內各大甲級醫院。校友中還不乏院士人才。安徽醫科大學在華東地區的影響力都非常強，畢業生在長三角地區就業市場很受歡迎。
1926年，原東南醫科大學於上海創辦，郭琦元先生為第一任校長。1930年1月更名東南醫學院。1949年底響應“面向農村，走向內地”號召，內遷安徽懷遠，成為安徽省第一所高等醫科院校。1952年遷址合肥，改名為安徽醫學院。1985年更名為安徽醫科大學。
東南醫學院創辦於上海南市，前身為東南醫科大學。
私立東南醫科大學、私立亞東醫科大學、私立南洋醫科大學，三校校址都在南市，且前後關聯。
1925年秋，滬軍營路私立亞東醫科大學因罷課學潮停辦。該校兼職教授郭琦元等於1926年5月在亞東醫大原址創辦私立東南醫科大學。同時成立以留日醫學人士褚民誼為首的校董會，郭琦元任校長。1926年9月開學。
創辦初，僅設專科。在校學生除原亞東醫大全體學生和東南醫大第一批新生外，還有廣州光華醫專轉來的部分學生，共計400人。1927年，學校仿照德、日學制，改辦為本科5年制，並設預科。1930年1月，改稱私立東南醫學院，經教育部批准立案。
1949年12月，東南醫學院及其附屬醫院遷到安徽懷遠縣。1951年6月22日，經中共華東局衛生部批准，東南醫學院由私立改為國有，並委託皖北行署正式接管，直屬中央衛生部領導。1952年10月改為安徽醫學院，校址合肥市。
安徽醫科大學的理科分數線歷來非常高，尤其是臨床，口腔等專業，在省內的錄取分數線超過本省安徽大學，和合工大錄取線逼近。
