燕窩在燉煮成熟之後會有一股非常濃郁的腥味，類似於蛋清的腥味，腥味是很多人不喜歡甚至是不能接受的，就導致很多人想吃燕窩滋補身體但不喜歡吃燕窩，或者嚐到燕窩的腥味噁心想吐。
這是因為燕窩中含有大量的蛋白質，這個蛋清腥味就是蛋白質的味道，如果燕窩有這股味道證明買到的燕窩是好燕窩。雖然能證明燕窩是好燕窩但確實是讓很多人所不喜，嚴重影響了食慾，怎麼能讓燕窩變得更好吃沒有腥味呢？
燕窩有腥味除了是蛋白質本身的味道以外，腥味大小與燕窩中水分含量的多少也有關係。剛買回來的幹燕窩，因為廠家考慮運輸損壞的問題會噴水減少燕窩的破損，到手的燕窩含水量多有較重的蛋腥味，可以將燕窩放在陰涼通風、乾燥的的方自然風乾，燕窩中的水分減少，燉煮出來的燕窩腥味會減淡。
經過上述處理的燕窩腥味變得很淡，是可以接受的，但有些人的味覺靈敏，或者想要追求更好的口感，在燕窩燉煮的過程中還可以進行二次加工，比如，燕窩快要燉煮成熟時加入冰糖或蜂蜜調味。
還有些關於燕窩的做法中，將燕窩與其他食材一同燉煮，這樣燕窩會與其他食材的味道相互融合，掩蓋燕窩的腥味，比如冰糖雪梨燕窩、益母草紅糖燕窩等，但是這種和其他燕窩一同燉煮是要注意燕窩的量，最好先出現做，因為不好保存。
當然了想要更好更有效的去除燕窩中的腥味，最簡單最有效的方法就是加入口感較好地食材，比如牛奶、椰汁、草莓等甜味重的水果，也可以將水果榨成汁或者做成果泥與燕窩攪拌均勻，更有利於燕窩腥味的掩蓋。
現在烹飪方法變得多種多樣，燕窩的腥味本就不重，只要稍加調味就可以掩蓋，而且現在還有將燕窩做成分子料理和燕窩月餅的，屬於燕窩的創新吃法；還有一種燕窩的吃法是紅燒燕窩，類似於紅燒海參但不建議吃，因為燕窩食用忌油膩，不過偶爾嚐嚐鮮還是很好的。
買回來的燕窩燉好腥味很重，就先不要吃，先將其自然風乾，然後密封保存好，不僅能減少腥味還能防止燕窩黴變，燉好的燕窩還可以加入冰糖蜂蜜等甜味重的調味品掩蓋，水果也是好的選擇。
