日前，五角大樓發佈緊急命令，限制和監控駐日美軍的行動，並嚴格控制美軍基地人員與外界的接觸，特別是“身體接觸”，以防止美軍基地官兵在未知的情況下發生“聚集感染”的情況。美國軍方消息人士發表的匿名消息中稱，沖繩的一名美軍飛行員在確診前與一名日本女孩有過密切地“身體接觸”，兩人之後的核酸檢測結果都呈陽性。
據日本新聞媒體報道，截至4月29日，日本感染新冠肺炎的人數增至13736例，其中394例死亡。儘管沒有美國百萬人口感染那麼嚴重，但日本醫學專家、新冠應對小組成員西普博教授還是提出警告，日本目前的感染數量僅僅只是“冰山一角”，因為檢測人數還很少，所以目前的確診人數還不足以說明問題，實際感染數量可能是目前數量的“十倍以上”。
事實上，為了確保東京奧運會能夠如期舉行，日本政府之前人為地限制了病毒檢測。在某種程度上來講，這強制降低了確診人數。然而，當奧運會被延期後，日本也沒必要掩飾疫情，開始為之前的決定“買單”。儘管所檢測到的人數仍落後於其他國家，但確診病例數量呈急劇上升的狀態，甚至有新冠患者倒在街上，這也引發了日本社會的恐慌。
當日本疫情開始失控的時候，駐紮在日本的5萬名美軍也開始發出“警報”。為防止“輸入病例”。據報道，駐日美軍指揮官中將施耐德十分緊張，要求他的士兵記錄下自己每天的行蹤和聯繫方式。同時，他警告說，任何違反禁令的人都可能面臨被遣返的懲罰。
值得注意的是，外界推測駐日美軍進一步實施嚴格限制可能為時已晚。根據最新消息，美國在日本的軍事基地目前正被新冠病毒所侵襲，這些流行病分佈在東京和沖繩等許多重要地區。
根據美國軍方消息，駐日美軍感染的病毒主要是從日本輸入的。例如，駐紮在日本橫須賀基地的美軍和日本駐東京部隊都和當地日本人有過“密切接觸”，駐紮在沖繩的美軍也不例外。
日本方面對美國軍方將受感染的“鍋”丟在自己頭上，表達了強烈的不滿，認為這是美國軍方為無力抗擊疫情的找的藉口。但有消息人士透露，美軍飛行員在“接觸”日本女孩之前，剛剛從歐洲回來，所以不清楚到底是誰感染了誰。
此前，日本媒體還指責美國作為“佔領軍”的特殊地位，給日本的防疫工作帶來很大麻煩。美國確診病例的數量高居全球第一，但是駐日美軍的家屬仍然可以自由進出日本。日本無法探清駐日美軍基地疫情的細節。但是一旦美國軍事基地的疫情失控，很可能會給日本造成巨大的麻煩。
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