大慈愛的女神女媧，創造了各種神獸，藉著它們不同能力幫助世人，令世界變得更美好，人、獸和睦相處。可是，大壞蛋元始天魔一心想統治所有人類，便派出手下天地盟主，將所有神獸變成兇惡的魔獸，為禍世人。
幸好南宮城的城主之子問天得到一頭天晶獸，並化成神兵——天晶！天晶神兵擁有神奇力量，能將魔獸擊倒；而他妹妹問雅則能把魔獸淨化馴服，變回善良本性的神獸。
南宮問天
南宮問天是動畫《神兵小將》中的主角南宮城的少城主，富正義感有鬥心，身手了得，左臂上的「綠珠護腕」更是使他力大無窮在拯救父親與大地的過程中，他勇敢樂觀、智勇雙全、孝順且充分發揮了其不屈不撓，不畏強暴的精神。
南宮問雅
南宮問雅，是動畫《神兵小將》中的女性角色，她是主人公南宮問天的妹妹，性格活潑可愛並且還很溫柔善良，是南宮城的小姐。她富有愛心和正義感，自小因失去母愛，所以與哥哥問天及爸爸南宮逸感情非常濃厚。
西門孝
西門孝是動畫《神兵小將》中的主角之一，西門城少主。體格比同齡的小孩高和胖，動作雖緩慢但不笨拙，他因為反應“慢三拍”鬧出不少笑話，但可在危急時刻改變體型，每次都有意想不到的事情發生。也有幾分狡黠。他的隨身兵器為水龍炮，神兵獸為小太虛。西門城少主，他性格直率，略缺自信心卻永不氣餒，一心要救出父親，令眾人感動。
北冥雪
北冥雪，動畫《神兵小將》中的主角之一。
北冥雪莊莊主北冥正的女兒，北冥雪莊的大小姐。擁有神兵神農尺和十方明亮，在戰鬥中多次使用神農尺救治同伴，是神兵小將中的得力治療隊員。
東方鐵心
東方鐵心，動畫《神兵小將》系列的女主角。明豔動人，是一個英姿颯爽、外剛內柔的女孩子。東方海閣之主東方雄之女，神兵獸是鳳凰。
在東方海被侵犯時被天地盟主捉拿，因為火災時摔傷失去記憶，誤以為自己是天地盟主的女兒，被天地盟主利用。後來在南宮問天等人的幫助下找回了記憶，並且成為神兵小將中的一員，從此展開了與問天並肩作戰的路途。
她的堅強自信、外剛內柔、英姿颯爽贏得了眾多觀眾的深深喜愛，她堅毅不屈，孝順又富有愛心，是《神兵小將》中當之無愧的“巾幗英雄”。
北冥雷
北冥雷，是動畫片《神兵小將》中的男性角色。
北冥雪的親生哥哥，出生並住在北冥雪莊，十分敬愛自己的父親，也非常寵愛自己唯一的妹妹北冥雪，曾被天地盟主的手下絕天機利用過，但最後還是和南宮問天、北冥雪、東方鐵心等人一起打敗了天地盟主，迎來了久違的和平。
玉鳳
動畫片《神兵小將》系列中的女性角色。
玉龍國元首，女媧傳人，玉島國元首玉燕的姐姐，問天問雅的阿姨。
南宮逸
國產動畫《神兵小將》系列中的登場角色。
南宮逸是南宮城城主，南宮問天兄妹之父，曾被虎魄魔化為天地盟主的忠實手下，自稱新任城主，聽命於天地盟主並統治南宮城。
東方雄
東方鐵心的媽媽，為人嚴厲，心機深沉，愛女心切。
後從問天處得知鐵心下落，四處找尋，為找到鐵心不惜一切，可見母愛之偉大！從來不讓小將們說他是嬸嬸。在旅途中一直保護著他們。
西門豪
阿孝之父，為人豪邁慷慨、治國有方，絕招“西門神拳”威力驚人。
北冥正
玉龍國北冥雪莊莊主。北冥雷、阿雪兄妹之父，為人不屈不撓、富有正義感，他善使青龍偃月刀，神獸為十方明亮。
天地盟主
從不以真面目示人，野心勃勃，一心想收服整個玉龍國，破壞大地祥和及魔化自然界所有動物，魔化東方鐵心為他的女兒，並以她作為天地盟的公主。常遭南宮問天破壞計劃，令他非除去南宮問天不可。後利用鐵心的感情要挾東方雄等人，卻被問天用團結天晶打敗。
兇閻王
天地盟主的手下，掌管西門區域，最終被南宮問天打敗，後來於第二十三集再次被打敗。
絕天機
天地盟主的手下，掌管北冥雪地，欺騙了北冥雪地之主北冥正的兒子北冥雷，最終被打敗，後來於二十三集再次出現被打敗。
喜無常
喜無常是國產動畫《神兵小將》中的人物，天地盟主的手下，掌管東方海閣。愛流口水，最終被南宮問天打敗，後在二十三集再次被打敗。
炎神王
坐騎烈火大象，是天地盟主的最後王牌。
女媧
大地慈愛的神獸之王，被稱為女媧大神。是從天上而來，並創造神獸和神兵獸的大神。
為了讓人類的生活更美好，創造了各種能變化成神兵(擁有神奇力量的器)的神兵獸。藉著各種神兵的不同能力，使獲得幫助的世人日子過得更愉快，希望人類與神獸是互相依賴，和平共處的。千百年來與原始天魔勢不兩立。
天晶獸
它是問天最親密的朋友，與問天互相感應，隨著問天對正義的領悟而變得更強大，一路上與問天一起擊退天地盟、玄天邪帝、無敵盟主、壞蛋三兄弟及其手下，是神兵小將們戰鬥的主力神兵。絕招有冰霜正義天晶（絕招寒冰破），火焰勇氣天晶（絕招火焰斬），光明希望天晶（絕招電光閃），紫電友情天晶（絕招紫電擊)，旋風自信天晶（絕招旋風破)。
玉靈龍
南宮家的守護神獸巨靈龍之子，能噴出熾熱的火焰攻擊敵人，它天真活潑又貪玩，冒險旅途中是大家的開心果。
巨靈龍
守護南宮家的神獸，玉靈龍之父。同南宮逸一起討伐天地盟主，後被天地盟主的虎魄魔化，最終被眾人解救。曾和南宮逸一起前往玉島國幫助問天等人。
鳳皇
守護東方家的神兵獸，華麗威武而體型龐大。它可變身成神兵鳳皇，代表水的力量，可以控制一切液體。是東方家族的坐騎。它善於飛翔，對鐵心極好。在故事之初受虎魄的影響成為魔兵，與問天等人為敵，後來在神舞的歌聲下恢復記憶，與鐵心一起協助問天打倒天地盟主。
小太虛
守護西門家的神兵獸太虛獸之子，與父親太虛獸外形相若的小烏龜，性格善良而沒機心。可變身成有趣好玩的神兵溜溜球，深得阿孝喜愛，在戰鬥時是小將們的得力幫手。
太虛獸
太虛獸，守護西門家的神兵獸，管理著西門域的水，變身後為神兵太虛，其力量如同颱風，但保存實力刮龍捲風。
神農獸
是指北冥雪地犬神農獸，它在雪地上跑步的速度極快，是北冥雪地的神兵中的跑步冠軍。雪橇犬形態上有神農尺的花紋，可變身為神兵神農尺，各種病症和傷患必能被它治癒，是小將們中不可缺少的醫生。變身後是十大天神兵的神農尺。
驚邪
野生神兵獸，外形是隻寄居蟹，擁有鋒利的鉗子，力大無比，比“綠珠護腕”給問天帶來的力氣更大，居住在東方海。可變身為神兵驚邪。後和問天一行人成為朋友，並幫助他們打敗了滾動海膽，喜無常和雙刀螳螂。
十方明亮
守護北冥雪地的神兵獸，一隻長著角和翅膀的馬，變為神兵時可指方向，戰鬥時可發強光讓對手睜不開眼睛。是北冥家族的坐騎。
神舞
野生神兵獸，原型是極樂鳥，可變身為神兵神舞，擁有世上最優美的嗓子，能唱出最動人的歌曲，使人想起美好的回憶從而使魔獸變回神獸，力量在問雅的淨化力量之上，為躲避天地盟主而居住在仙音林，曾被阿孝的歌聲引出，在對抗大耳將軍時啟發問天要自信，並幫助東方鐵心、南宮逸和巨靈龍恢復記憶，也曾被天地盟主魔化，後因北冥雷的感化而恢復善良本性。
猛虎
天地盟主的坐騎，原型為劍齒虎（猛虎），可變身成魔兵虎魄，它噴出來的怪煙把善良的神兵獸變成邪惡的魔兵獸，也可令人失去善良本性，跟隨天地盟主，是天地盟主征服玉龍國的左右手，本是被元始天魔魔化的神獸，後被問雅淨化。
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