▍商品有機肥與糞肥的不同之處
首先，商品有機肥比糞肥“無害”
兩種肥料的區別重點在於“腐熟”和“無害”。與商品有機肥相比，糞肥存在許多缺陷：
一是含鹽分較多，容易使土壤鹽化。
二是糞肥帶有大量的病菌、蟲卵，引發棚室內的病蟲草害；
三是糞肥養分含量不穩定，不能做到合理補肥。
四是糞肥內若含有害物質、重金屬物質時，僅憑藉高溫發酵不能去除。
其次，商品有機肥改良土壤效果更迅速若是土壤出現了不良狀況，使用商品有機肥改良比糞肥更加快速
這是因為商品有機肥具有潔淨性和完熟性兩大特點。商品有機肥在製作過程中不僅進行高溫殺菌殺蟲，通過微生物完全發酵，並且很好地控制氧氣和發酵溫度，使有機物質充分分解成為直接形成團粒結構的腐殖質等，同時產生的氨基酸和有益代謝產物得以保留。使用後不會產生對蔬菜有影響的物質。
再次，商品有機肥的養分配比更合理
商品有機肥中的各類養分是可調整的，可以針對不同的土壤狀況使用不同養分含量的產品。
棚室土壤改良選擇什麼樣的商品有機肥
商品有機肥的品種很多，而用於製作商品有機肥的原料更多，因此在改良土壤的時候也應選擇合適的商品有機肥。
那麼哪些原料可用於製造商品有機肥呢？
一是自然界有機物，如森林枯枝落葉。
二是農業作物或廢棄物，如綠肥、作物秸稈、豆粕、棉粕、食用菌菌渣。
三是畜禽糞便，如雞鴨糞、豬糞、牛羊馬糞、兔糞等。
四是工業廢棄物，如酒糟、醋糟、木薯渣、糖渣、味精發酵氨基酸尾液。經過無害化處理以後，這些原料生產的商品有機肥都可以用於棚室蔬菜生產。
而商品有機肥根據功能不同又分為很多種類，在補充有機質的基礎上添加大中微量元素、甲殼素、生物菌等等不同的功能物質，使得商品有機肥的效果又大大提升。在這裡分析兩類
一是含有甲殼素的有機肥。甲殼素的功能很多，很多菜農也學會了使用甲殼素來生根養根，同時對於有根結線蟲的土壤，可使用甲殼素與阿維菌素配合防治。在有機肥中添加了甲殼素，在改良土壤的同時可利用甲殼素抑制黴菌等有害菌的滋生，提高放線菌等有益菌數量的特點減少土傳病害的發生。當蔬菜定植後，甲殼素養根護根的作用也可充分發揮出來。真正達到改土防病養根護根的效果。濟南阿波羅甲殼素肥業有限公司的智能牌功能性有機肥在這方面走在了商品有機肥的前沿。
二是含有生物菌的有機肥。生物菌與有機肥配合使用，能更快更好地改良土壤，主要有兩大特點：
一是富含有益微生物菌群，環境適應性強，易發揮出種群優勢。
二是富含生理活性物質，如吲哚乙酸、赤黴素、多種維生素以及氨基酸、核酸、生長素等。
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