這天傍晚，警察馬克前往洛杉磯警局將打架被抓的兒子特倫特保釋了出來。二人上了地鐵準備回家。地鐵上，父子兩個人正在談心，此時行駛中的地鐵突然猛烈的震動了起來，然後停止不動。馬克來到乘務室詢問發生了什麼，乘務員奧黛麗告訴馬克地鐵停電了，並且聯繫不上總檯。這時對講機了突然傳出了聲音：千萬不要看，不要…不要看那道光。隨後地鐵外面傳來了持續不斷的震動。馬克預感到發生了什麼，他決定帶領車上的眾人先行離開列車，沿著地鐵軌道找到出站口。
一行人沿著地下隧道終於來到了出站口，這時外面突然照射進了耀眼的藍光，看到藍光的眾人身不由己的走出地鐵站，特倫特也在其中。天空中竟然有一艘巨大的外星飛船，被藍光照耀著的眾人身體突然漂浮起來，被吸扯著飛向外星飛船。千鈞一髮之際，馬克跳起來抱住了特倫特，另一隻手抓住了地鐵站的門框。藍光突然消失，二人重重的摔在了地上，馬克抱起兒子趕緊跑回了地鐵站。
回到地鐵站馬克告訴了奧黛麗等人外面發生的事情，一番商議之後眾人決定沿著地鐵的地下隧道尋找救援。走了一整夜的眾人找到了一處檢修室，眾人進入檢修室。在裡面奧黛麗利用檢修室裡的無線電聯繫上了軍隊，無線電對面告訴她沒有人能夠救援他們，如果想活命的話眾人只能去海軍H基地。而此時外面戰鬥機正在進攻外星母艦的，一枚核彈被髮射出去，片刻之後巨大的震動來襲，地下隧道一片一片的塌方。一陣煙塵散去，馬克幾人陸陸續續的從地上站了起來，地下隧道被炸開了一片，通向了外面，許多躲閃不及的人被埋在了廢墟里面。馬克等人意識到這可能是通往外界的唯一出路，幾人決定從這裡離開隧道。離開地下隧道的眾人發現外面佈滿了巨型怪物，無處可躲的眾人被抓進了外星母艦。
在外星母艦中醒來的馬克發現四周躺滿了昏迷不醒的人類，不斷的有觸手將人類的大腦取走，馬克逃出了這裡。在飛船中四處尋找特倫特的馬克被章魚怪發現，眼看就要命喪於此，這時突然衝出一個外星人殺死了章魚怪。思量之後馬克決定跟著這個外星人離開。外星人帶著馬克來到了一個隱蔽的房間，一個快要生產的孕婦躺在裡面，竟然是艾琳！上期我們提到過艾琳被一個外星人救走，果然外星人正是傑裡德恢復了意識。而之前艾琳懷孕只有三個月左右，經過一夜之後竟然要生產了。艾琳告訴了馬克之前發生的一切，馬克得知了一個驚人的真相：整艘飛船隻有一個真正的外星人，其於全是使用人類大腦的奴隸。馬克幫助艾琳產下了一個小女嬰，艾琳停止了呼吸。
馬克要傑裡德幫助自己找到特倫特，而自己將會照顧傑裡德的女兒，傑裡德同意了馬克的提議。他帶領馬克來到了母艦的指揮室，找到了特倫特與奧黛麗的位置。這時外星人的領袖回來了，傑裡德表示自己將會炸燬飛船並將馬克傳送到特倫特的位置。傑裡德與外星人首領戰鬥之後被打倒在地，外星人首領則追逐馬克去了。面對趕來的外星人首領幾人奮起反抗，一番打鬥之後，特爾特身亡，被外星人取走了大腦，眼看奧黛麗與馬克危在旦夕，飛船突然爆炸。原來是傑裡德臨死之前引爆了飛船。飛船從空中墜落在地，外星人首領被砸倒在一片廢墟之中，馬克與奧黛麗帶著傑裡德的孩子終於逃出了飛船。
另一邊，莰雅兄妹看到飛船從天空中墜落，便來到了飛船墜落的地點，他們撿到了一枚籃球大小的藍白色的蛋。逃出飛船的馬克幾人遇到了莰雅兄妹，原來飛船墜落到了金三角。馬克與莰雅兄妹一番交流之後跟隨他們回去基地溼婆神廟。在路上傑裡德的孩子不斷生長，此時僅僅生下來只有幾個小時卻已經像四五歲的孩子那般大了。來到溼婆神廟之後化學家哈珀給小女孩做了檢查，發現她的DNA已經和人類不一樣了，不確定小女孩到底還是不是人類。
莰雅將自己撿到的蛋交給了哈珀，一番檢查之後，哈珀發現這個蛋是外星人的生物武器彈藥，將它發射出去之後就會漂浮在空中放射出藍色的光芒，控制人類的心智。它擁有和人類相同的DNA，哈珀告訴眾人一個驚人的猜測：人類可能是外星放養在地球上的，每隔幾百萬年外星人就會來到地球收割人類的大腦，但是他們沒想到，人類是會進化的，小女孩的血液可以使外星人的生物武器無效。也就是說如果能夠將血清從外星母艦裡發射出來，就能解放所有外星奴隸。這也是為什麼外星人首領一直追蹤傑裡德女兒的原因。
外星人的追擊終於到了溼婆神廟，巨大的外星母艦漂浮在空中，無數的外星奴隸從四面八方包圍過來。馬克不顧眾人的反對決定冒險回到外星母艦將小女孩的血清發射出去，喚醒所有奴隸的意識。來到飛船大炮的馬克被一個外星人發現，打鬥了起來，馬克將外星人推下了一旁的洞裡。終於馬克將血清注入到了彈藥裡面，彈藥被裝進大炮，強烈的紅光從大炮裡發射出來。一旁的外星人瞬間恢復了意識，原來他就是特倫特，但是外星人首領同樣發現了這裡的情況，他單手撕下了大炮，扔到了地上，炮彈最終沒有被髮射出去。特倫特與首領打鬥了起來。而這時地面傷亡慘重，莰雅，哈珀率先身亡，形勢危急，眼看著基地就要被全滅。
小女孩在所有人都沒有注意的時候獨自來到了大炮旁邊，她伸手觸摸大炮，竟然在給彈藥重新注能。注意到這一幕，特倫特舉起大炮瞄準首領。大炮瞬間發射出去，擊中了首領，彈藥飛向空中，放出紅色的光芒。所有的外星奴隸恢復了意識，人類勝利了。眾人高興的聚集在一起，他們為小女孩起名叫蘿絲，歡呼勝利。
我是船長蘿絲，這就是我名字的由來，現在反擊的時刻開始了，我們不僅是在地球上反擊，彈藥發射！
這就是科幻大片《天際浩劫2》的劇情了，小編之前做過第一部的劇情。有興趣的朋友可以自行去看一下電影哦。
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