齊魯網·閃電新聞2月2日訊（記者 劉洋）當前，正值防控新型冠狀病毒疫情的關鍵時期，尋找靶點藥物是科研攻關的重要工作之一。海洋試點國家實驗室及時啟動應急研發任務，利用實驗室學科、平臺、團隊、機制優勢，組織科研人員，主動出擊，針對多個重要抗病毒靶點開展了藥物虛擬篩選，力爭為疫情防控貢獻力量。
基於前期已經建立的國際上首個海洋天然產物三維結構數據庫、科研人員群策群力，從中國海洋大學、北京大學、上海交通大學、中山大學、浙江大學、中科院南海所、中科院微生物所和青島海洋生物醫藥研究院等多家高校和科研院所，收集可獲得實體化合物的天然產物分子結構信息74,382個。擬利用 “智能超算與生物實測耦合的全鏈條創新藥物研發體系”，對這些天然產物分子、已上市藥物和中藥有效成分，進行分子對接、分子動力學模擬等藥物虛擬篩選。
為了充分利用全國各地科學家們貢獻的海洋天然產物信息，在廣泛徵求賓夕法尼亞大學、復旦大學、華中農業大學等多家單位冠狀病毒專家建議基礎上，通過生物信息學分析研究病毒基因的保守性，利用知識圖譜技術收集類似蛋白結構信息，確立了7個藥物篩選靶點，分別是：病毒配體Spike蛋白、病毒受體ACE2蛋白、病毒蛋白酶PLpro（papain-like protease）和Mpro (3C-like protease,或main protease)、介導病毒RNA帽子的甲基化修飾的nsp16、與病毒轉錄複製相關的RdRp（RNA-dependent RNA polymerase）和潛在的病毒用於干擾宿主免疫的X domain蛋白。通過同源模建、分子動力學模擬等手段，構建了可直接用於虛擬藥物篩選的靶點口袋。
為了加速對抗新冠病毒的藥物篩選進程，海洋試點國家實驗室將這些靶點模型向社會開放共享，供廣大科學家和企事業單位用於非盈利性目的的藥物篩選工作。使用者可在http://ncovtarget.qnlm.ac 簡單註冊後，下載使用。後續靶點模型更新，還將適時在該網站公佈。
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