02.25 看國外:科學家繪製了非洲豬瘟病毒基因組圖,發現30個新基因

科學家繪製了非洲豬瘟病毒基因組圖

來自英國和波蘭的一組研究人員已經在整個非洲豬瘟病毒(ASFv)基因組中繪製了基因表達圖譜。這有助於確定它們的激活順序以及發現新基因。

研究人員與倫敦大學學院(UCL),Pirbright學院和波蘭華沙大學建立了聯繫,並在同行評審的《病毒學雜誌》上發表了他們的研究。

他們的作者寫道:“在這裡,我們提出了第一個急需的全基因組轉錄組研究,該研究提供了對ASFv轉錄的獨特見解,併為未來對ASFv基因的功能分析提供了資源,而這對於對抗這種毀滅性疾病至關重要。”

看國外:科學家繪製了非洲豬瘟病毒基因組圖,發現30個新基因

首次繪製了ASF病毒的總基因組圖。插圖:Shutterstock

發現30個新基因

根據UCL網站上的新聞稿,這項研究可以為那些開發疫苗和抗病毒藥物以預防由該病毒引起的致命豬病的人提供重要信息。首席教授Finn Werner解釋說:“我們的數據顯示,ASFv具有複雜的哺乳動物控制基因表達的方法,<strong>該方法使用特定的啟動子使RNA聚合酶能夠區分病毒感染過程中應表達哪些基因。我們的研究還發現了30多個以前未知的新基因。”

在他們的研究中,研究人員使用了下一代測序技術來分析ASFv表達的基因。他們由此創建了完整的遺傳路線圖,揭示了在整個感染週期中打開不同組的ASFv基因的順序。

ASFv可以改變激活基因的模式

UCL網站上的新聞文章繼續描述,包括ASFv中的基因在內的基因是通過稱為“轉錄”的過程激活的。該過程由稱為RNA聚合酶的分子機器執行,該機器通過確保在感染期間的正確時間表達DNA中編碼的信息來充當“守門人”。RNA聚合酶根據位於基因之前的特定DNA序列或“啟動子”來查找基因。

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研究小組證明,在早期感染期間表達的基因與以後表達的基因具有不同的啟動子,從而使病毒根據感染的階段改變活化基因的模式。用於DNA複製和逃避免疫系統的基因會在感染週期的早期打開,而那些涉及為新病毒顆粒創建蛋白質的基因則在稍後被激活。

ASFv具有非常大的DNA基因組

Linda Dixon博士是Pirbright ASFv集團的負責人,也是該科學文章的合著者。在該Pirbright網站上的新聞文章,她說:“<strong>非洲豬瘟病毒具有非常大的DNA基因組。為了進行比較,流感病毒表達8個基因,而ASFv表達150至190個基因,迄今為止,這使得科學家難以鑑定和確定每個基因的重要性。<strong>我們的研究有助於弄清哪些基因在感染的不同階段中很重要,以便更好地瞭解其功能。”

根據新聞報道,通過提高對ASFv基本生物學的認識,該研究提供了重要信息,將有助於推進疾病控制方法的研究。

病毒學雜誌

》上的研究文章由英國倫敦大學學院的Gwenny Cackett,Dorota Matelska,MichalSýkora,JürgBähler和Finn Werner撰寫。Raquel Portugal和Linda Dixon,英國Pirbright研究所;和波蘭華沙大學的Michal Malecki。


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