寫期刊論文容易，但寫出一篇高水平的期刊論文就不容易了，更別提寫出CNS（Cell, Nature, Science）級別的期刊論文。在幾年前，科研工作者能發表一些英文的SCI論文就算很厲害了，現在水漲船高，科研人能看上眼的是高影響因子的論文，尤其崇拜那些能發CNS系列雜誌的學人。只要論文不造假，崇尚發表好論文是個好現象，對推動科技進步將很有幫助。
但事實上，除少數科研明星外，對國內大多數科研人員來說，在CNS上發表論文依然是一個夢想。能在專業領域內國際上最好的雜誌上發表一篇高水平的論文也不是件容易的事。
我們在科研中會發現這樣的現象：做相似或相關的研究，付出了同樣艱辛的勞動，有些實驗室能經常發表許多很好的論文，而有些實驗室發表的論文卻在低檔次水平徘徊。
為什麼會發生這種現象呢？低水平論文變成高水平論文的到底難度在哪呢？
在回答這個問題前，首先歸納一下高水平論文的特點：
（1）論文的假說要新，有創造性，而且有較大的理論或實際應用價值；
（2）支持假說的證據要充分，嚴謹；
（3）數據解釋合理，結論清楚；
（4）寫作要讓複雜的東西易懂，反之，則是低水平論文。
根據我寫論文、審稿和閱讀論文的經驗體會，其實很多論文的假說創新性不錯，可支持假說的證據往往不足，有些很有價值的假說提出了幾十年，甚至幾千年，也沒有得到有力的證據支持。
也就是說：想到容易，可做到就難了。比如：“地球以外有外星人存在”這一假說已經有很久了，可至今沒找到有力的證據。
再比如：“誘導型多能幹細胞（iPS）可治療截癱”。這一假說雖然取得了一些證據，但離找到充分的證據證明iPS能安全有效的治療截癱尚有很長的路要走。
據Baniel W.Byrne的研究，71%的論文投稿因為課題設計問題被拒。課題設計的問題多是在設計時沒有考慮如何獲取充分而嚴謹的證據來支持假說，從而導致論文檔次上不去。
如何獲得充分而又嚴謹的證據？我認為可以從以下幾方面著手：
（1）儘可能多的證據來論證同一個假說。比如：要證實A基因的過度表達可誘導癌症，可用：
(a)體外證據（體外轉染A基因到正常細胞，可轉化成惡性腫瘤細胞）；
(b)動物體內證據（如:A基因的轉基因老鼠可誘導癌症）；
(c)人體證據(如:A基因在人體癌組織中表達升高)。生物醫學科研最終是為解決人類疾病服務的，因此人體的證據有利於提升論文的檔次和價值。
（2）儘可能提供不同的實驗方法來論證：比如要證實A基因在癌細胞表達升高可用免疫組化的方法在蛋白質水平顯示細胞內表達的分佈情況，也可用定量逆轉錄PCR的方法在mRNA水平檢測A基因的表達，兩種或更多的不同方法同時應用來證實同一問題，這樣的結果就顯得更可靠。
（3）儘可能找到直接的證據：比如，要證實轉錄因子對下游基因的調節，單知道該轉錄因子可增加下游基因的mRNA或蛋白質表達是不夠的，因為你不知道該轉錄因子是直接作用還是通過另外的基因間接起作用，要取得直接證據可用ChIP實驗來證實轉錄因子蛋白可直接與下游基因的啟動子結合，從而上調下游基因的表達。
（4）儘可能將實驗數據聯起來獲得一個相對完整而又嚴謹的科學故事：現在發表高水平大論文，單做一兩個，甚至幾個實驗是不夠的，需要做一系列的實驗來把你的論據和論證串通起來，形成一個不一定動聽但完整而嚴謹的科學故事。
儘管提供好的證據來支持假說最為重要的，也是最難的，但是在論文的討論中如何合理的解釋數據結果也至關重要。經常發高水平論文的人其實也是原始數據解釋的高手。
而有些人，有好數據，卻因為沒有合理的解釋好，所得出的結論不夠清楚，導致論文檔次下降，這確實有點冤。
解決這一問題的辦法有：
a.分析文獻，看是否能從文獻中得到啟發；
b.請經驗豐富的同行認真閱讀你的論文，提出建議，可彌補你想不到的地方。
寫專業性很強的科技論文，能被學科背景不是太強的半外行容易看懂很重要。前幾年我投的一篇論文給雜誌，三次都被拒稿，後來認真閱讀了審稿人意見，發現有些審稿人並沒有完全理解我們的論文。
後來我們重新修改了論文,使之更容易理解後,論文很快被接受了。我覺得，如果有兩個或以上的審稿人都誤解了你的論文，那一定是你寫作有問題，別光罵審稿人或編輯水平臭，一定要好好從自己寫作上找原因。
我的做法是，在論文完稿後讓英文水平不錯，但專業背景不強的人讀你的論文，如果他們能讀懂，說明你的論文不錯，並根據他們的意見反覆修改。總之，把複雜高深的科研成果用易懂而嚴謹的方式寫出來是我們論文寫作努力的方向。(來源：碩博論文網)
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