之前我們在講寶石礦物的晶體化學分類的時候，按照不同的級序將寶石劃分為大類、類、亞類、族、亞族、種、亞種、變種等，但是種卻是寶石晶體化學分類的最基本的分類，那麼決定寶石礦物中的基本因素是什麼？

對於寶石礦物的分類，主要是根據寶石礦物的晶體化學特徵進行分類的，因此決定寶石礦物中的因素也必然有兩個方面，一是晶體結構特徵，一個是化學組成。

首先，只考慮化學成分，不考慮晶體結構不能確定一個寶石礦物種。

這是一個非常簡單的道理，例如，同樣是由C元素組成的固體石墨與鑽石是兩個不同的礦物種，他們之間的結構特徵有著非常明顯的差異，從而導致兩者之間的性質上，也會存在非常明顯的差異。

在比如說，化學成分同樣是Al2SiO5的晶體，結構不同，卻決定了不同的礦物種。當硅氧四面體組成鏈狀時，形成鏈狀硅酸鹽，則為矽線石，當硅氧四面體孤立存在的時候，形成島狀硅酸鹽，則為紅柱石和藍晶石，當Al全部為六次配位時，形成的藍晶石，當部分為四次配位，部分為六次配位時，形成的就是紅柱石。下圖為紅柱石、藍晶石和矽線石的相圖。

第二，只考慮晶體結構，不考慮化學成分，同樣不能確定一個寶石礦物種。

例如，螢石與石鹽的晶體結構都屬於立方面心格子，但是他們之間的化學成分卻有這明顯的差異，螢石的化學成分是CaF2，而石鹽的化學成分是NaCl。所以很顯然，這是兩個不同的礦物種。

下圖為螢石的結構。

所以，無論是單純的考慮晶體結構，還是單純的考慮化學成分，都不能同時確定一個寶石礦物種。當確定一個寶石礦物種的時候，需要同時考慮兩個方面，一個是寶石礦物的化學成分，一個是寶石礦物的晶體化學結構特徵。

但是對於任何一個寶石礦物種來講，其化學成分並寶石固定不變的，而是在一定的範圍內變化，最典型的就屬於寶石的類質同象（下一節會講到），另外晶體的晶胞參數也並不是固定不變，也同樣會在一定範圍發生變化，最典型的就是晶體的各種缺陷。但是這些小範圍的變化，並不足以改變一個寶石礦物種的分類。因為這些變化是在保持其結構和物理化學性質基本不變的前提下。

例如剛玉，三方晶系，當不含任何次要或者微量元素組成時，其顏色為無色，但是當部分的Al被Cr所替代時，呈現紅色，此時Cr的含量非常少，不足以改變剛玉礦物的晶體結構，晶胞參數也僅僅引起不大的變化，並且除了顏色以外，其他的物理化學性質的變化非常少，所以他依然屬於剛玉礦物種。下圖為無色藍寶石。