腳腐病是一種真菌性病害，又叫裙腐病和褐腐病，是我國柑橘果樹的重要病害之一。高溫多雨潮溼的季節或澇害後果園排水不及時，都是該病發病的盛期。一旦發病，治療不及時，病斑在適宜條件下，就會不斷擴展侵染，輕則流膠，重則整株死亡。
全國各柑橘區均有發生，西南橘區較嚴重，病發時常使根頸部皮層死亡，引起樹勢衰弱。因此，在柑橘腳腐病的發病盛期，要做好預防工作，及時發現病害，及時治療。
柑橘腳腐病主要危害柑橘根頸部，向下蔓延至根部，引致主側根腐爛；病株根頸部皮層初呈水漬狀褐色溼腐，具酒精味並滲出膠液，乾燥時膠液凝結為粒塊，嚴重時根頸樹皮腐爛，可環繞根頸部造成柑橘樹死亡；病樹葉片變小、變黃，容易脫落。
該病的病菌以菌絲在病部或以菌絲體或卵孢子隨病殘體遺留在土壤中越冬，翌春病菌產生的孢子借風雨或者流水傳播，從根頸部傷口入侵。
據調查，耕地果園發病較高，其原因有：
1、橘樹栽植過密，導致後期柑橘鬱蔽，樹盤基本不見光，引起腳腐病的發生；2、定植過深，導致嫁接口被埋；3、土質粘重，土壤通透性差；4、高溫多雨、果園低窪、排水不良和樹幹基部皮層受傷等，都有利於病害爆發。
防治方法：
1、選用抗病砧木。選用枳殼、酸橘、枸杞橙等抗病砧木；採用感病砧木的幼齡病樹，可在其主幹基部靠接2-3株抗病實生砧木苗。
2、強化預防。清理排水溝，降低地下水位；除去土露根頸。將種植過深埋住嫁接口的植株清理上層土壤，使嫁接口露出來；要進行疏密，對密植園隔株伐，保證樹盤通風透光，降低溼度。
3、 病樹治療。將根頸病部位的土壤趴開，刮除腐爛的部分，然後塗1：1：10的波爾多漿、2%硫酸銅液、25%甲霜靈可溼性粉劑200-300倍液、70% 甲基硫菌靈可溼性粉劑100-200倍液，再填上河沙或新土。也可在病部縱劃刻痕後再塗甲霜靈或甲基硫菌靈。
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