96年舒淇從臺灣到香港發展，被王晶發掘主演了《紅燈區》、《玉蒲團之玉女心經》，2001年6月25日，美國《時代》亞洲版找來舒琪作為封面人物，並對舒琪進行了專訪，2002年，為拍攝呂克·貝松監製的美國動作片《玩命速遞》，舒淇在法國逗留了3個多月，同年8月，舒淇出演的《夕陽天使》上映。
2003年與劉燁主演的《美人草》，這是一部以七十年代雲南生產建設兵團知青生活為背景的愛情片，改編自著名美籍華人作家石小克的小說《初戀》，2004年，舒淇出演中泰合作電影《見鬼2》，“見鬼系列”是陳可辛與彭氏兄弟共同打造的恐怖電影。
2005年舒淇在古裝電視劇《風塵三俠之紅拂女》中扮演了唐傳奇裡的俠女，2月舒淇主演的《韓城攻略》上映，此片是由香港寰亞電影公司推出的2005年春節賀歲片，耗資港幣4000萬，也是《東京攻略》的姊妹篇，同年10月27日由舒淇主演的兩部影片《最好的時光》和《怪物》同時上映。電影《最好的時光》是舒淇與導演侯孝賢再次合作，舒淇並以此獲得第四十二屆金馬獎最佳女主角獎。
2006年3月，舒淇從韓國拍了《我老婆是老大3》返港，又接拍了電影《傷城》和金城武上演了吻戲，2009年，舒淇被評選為“世界十大美女”之一，“21世紀新時代亞洲美女的最佳代表”2011年，舒淇主演了侯孝賢導演的第一部武俠電影《聶隱娘》，舒淇飾演的是一位懂得幻術、武功高強的俠女，舒淇這次的片酬高達850萬人民幣。
2012年《情謎》由舒淇和余文樂共同主演，影片中，舒淇飾演的雙胞胎姐妹，與余文樂飾演的舞臺劇演員阿楠產生了感情關係2013年，《西遊·降魔篇》由文章、舒淇主演。故事圍繞年少時期的唐僧與段小姐的相識經過及冒險歷程。舒淇飾演的驅魔人段小姐，為陳玄奘降妖除魔，最後為陳玄奘而死。
2015年主演電影《剩者為王》，在電影《鬼吹燈之尋龍訣》中飾演愛好考古的美籍華人Shirley楊；該片上映8天票房超過10億元 。主演經典愛情喜劇《我最好朋友的婚禮》中國版 。11月，攜手李宇春擔任浙江衛視《燃燒吧少年》選秀節目掌門人2016年1月新電影《健忘村》在臺灣墾丁取景拍攝 ，7月參演馮德倫執導的新片，在捷克拍攝。
2017年8月11日，主演動作冒險電影《俠盜聯盟》上映，飾演角色葉紅。[14]2017年12月5日，宣佈“暫告演員生涯”，暫停演藝事業，以健康為重。但沒有息影，只是作短暫休息。
2018年3月23日舒淇應邀出任第八屆北京國際電影節“天壇獎”國際評委會評委[15]。6月，加盟綜藝節目《中餐廳》第二季[16]，8月10日主演的電影《一出好戲》上映，8月25日參加綜藝節目《快樂大本營》。
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