每當到降水較多的時候，需要人工授粉火龍果遇到很多問題，沒法進行授粉困擾著大家。
在授粉的過程中，現在大家一般都採取兩種方式：一是直接使用毛筆進行點花（花粉取自於同一朵花）；二是在別的花或者是別的品種採集花粉進行授粉。
火龍果授粉，最好選擇異花授粉最好，比較好的一種方式就是4行紅肉火龍果間一行白肉火龍果，也就是專門種植“花公”進行採集花粉。
另外，建議把授粉的品種保留部分比較好的，然後不斷地進行改種自花授粉的品種。
若有特殊原因確需備用的，可以把收集到的花粉密封起來，一定要保持乾燥，這樣花粉活性才會高，然後放在冰箱0~5℃的條件下保存。
白肉型火龍果始花的時間要比紅肉型晚一個月，有條件的可以在花粉多時將花粉收集起來貯藏備用。
在指低溫陰雨和大風大雨等，不僅使昆蟲活動受阻，更會降低花粉活力。採用設施栽培能在一定程度上減輕災害性天氣的影響，提高火龍果的授粉率。
如果開花期碰上雨天，可以用個袋子把花苞給罩起來，第二天早上授完粉也罩上，這樣火龍果也能順利結果的。
花粉的採集：火龍果屬雌雄同花，需保留95%以上的花，才能保證產量。因此，不能把花摘下來，最好也不要用力搖來採集花粉，而應在傍晚花開後或清晨花凋謝前，用消毒過的毛筆或毛刷將火龍果不同品種（以多品種的混合花粉較好）的花葯和落在花瓣上的花粉輕輕刷至消毒過的表面皿中，以免失去活力，影響授粉效果。
授粉方法：主要是人工點授，即將採集好的花粉充分混合均勻，用毛筆蘸花粉點授柱頭，使花粉均勻塗抹在柱心處。
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