紅曲是紅曲菌加入蒸熟的米經發酵而得，可以應用於肉製品、豆腐乳、豉油或酒等食品，並於再發酵的過程中產生天然紅色色素、水解酵素及膽固醇合成抑制劑，以及降血壓物質γ胺基丁酸等有益人體的代謝產物。整體來說，紅曲對健康較顯著的影響，就是幫助降低膽固醇及血壓。
泡菜在製作的過程中，除了保留了原本的營養素之外，還會產生一些有益菌，例如：乳酸菌。對人來說，乳酸菌有保健腸道、調節免疫力等功效。但也有研究分析韓國人罹患胃癌比例高居不下的原因，關鍵就在於吃太多泡菜了。會出現泡菜致癌的研究結果，可能的原因在於高鹽醃製。高鹽分醃製的發酵蔬菜，有較高的罹患胃癌風險，這可能與高鹽食物去影響到幽門螺旋桿菌的外膜蛋白基因轉錄改變有關，而幽門螺旋桿菌正是導致胃癌的主要原因之一。
納豆是黃豆經蒸煮，再透過枯草桿菌的酵素轉化而得。發酵後取得的納豆，不僅保留了黃豆本身的營養素，還多了納豆激酶，而研究發現納豆激酶有幫助清除血栓及降血壓的保健效果。
味噌是以黃豆和穀物在食鹽水中添加麴菌發酵而得，含有活性酵母及酵素活性、多種胺基酸、維生素E、維生素B群、大豆異黃酮、卵磷脂等營養素。納豆對於人體健康，具有調節生理機能、促進循環、防止高血壓、抗老化等功效。
豆腐乳是一種2次加工的發酵食品，先將黃豆製成硬豆腐，再利用黴菌發酵、加鹽醃製而成。豆腐經發酵變成豆腐乳後，蛋白質被分解成較小的分子，較有助人體吸收，並且發酵後的維生素B12含量也增加，能補充身體所需的維生素B12。維生素B12缺乏易出現疲倦無力、貧血、思考力下降、易怒、感覺異常等症狀。
芝士屬於六大類食物的乳品類，類似濃縮的牛奶，與牛奶一樣富含鈣質、優質蛋白質和維生素B2等營養素，有助預防骨松。特別的是，由於牛乳在發酵過程中，乳糖會轉變為乳酸，所以對乳糖不耐症的人來說，芝士是比牛奶更好的選擇。另外，芝士可以增加腸道內的比菲德氏菌，故有整腸的保健效果。
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