祁連山的平均山脈海拔在4000米～5000米之間，高山積雪形成的碩長而寬闊的冰川地貌奇麗壯觀。
海拔高度在4000米以上的地方，稱為雪線，祁連山的雪線之上，常常會出現逆反的生物奇觀。在淺雪的山層之中，有名為雪山草甸植物的蘑菇狀蠶綴，還有珍貴的藥材——高山雪蓮，以及一種生長在風蝕的岩石下的雪山草。
雪蓮、蠶綴、雪山草又合稱為祁連山雪線上的“歲寒三友”。
微風吹來，會使人產生返璞歸真、如入夢境的感覺。著名的大馬營草原，地形平坦、水草豐美、蜚聲中外的遠東第一大牧場──山丹軍馬場就建在這裡。
祁連山的四季從來不甚分明，春不象春，夏不象夏。所謂“祁連六月雪”，就是祁連山氣候和自然景觀的寫照。
祁連山的原始森林景區更是風光迷人，立夏之後，山林之中一片一望無際的綠色海洋。祁連山的原始森林區內，有15.7萬公頃，200多萬立方米的森林資源。是青海省較大的林區之一。
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