首先，國家支持微生物肥料發展，同時鼓勵進行微生物肥料在“土壤調理”方面的技術研發。生物產業是我國七大戰略性新興產業之一，生物肥料部分則是生物產業的重要部分。
2012年12月國務院發佈《生物產業發展規劃》，微生物肥料被納入到“農用生物製品發展行動計劃”，明確提出要加快突破“保水抗旱、荒漠化修復、磷鉀活化、抗病促生、生物固氮、秸稈快速腐熟、殘留除草劑降解及土壤調理”等生物肥料的規模化和標準化生產技術瓶頸，提升產業水平。
其次，我國的微生物資源具有菌種資源豐富、微生物肥料產品種類繁多、應用範圍廣泛的特點。
豐富的微生物資源為發展微生物肥料產業提供了保證，同時我國微生物種類多樣的特點又與土壤中的汙染物種類較多的現實相對應，可以修復土壤中的多種汙染物。
近年來，以秸稈腐熟劑、生物有機肥為代表的微生物產品在農業上廣泛運用，為土壤生態修復立下汗馬功勞。
目前，全國微生物肥料年產突破1000萬噸，應用土地面積超億畝。
最後，微生物肥料具有“四兩撥千斤”的獨特功能，既能活化土壤，提升肥效，又能保障農產品質量安全，是農業可持續發展不可缺失的投入品。
同樣，微生物肥料功能多樣，能夠充當分解者（秸稈分解、土壤有毒有害物質降解）、轉化者（磷、鉀、鈣、鎂等養分的有效形態轉化）、生產者（生物固氮、產生各種促生物質）等。
所以，微生物肥料的前景非常大！
其實在中國，微生物肥料已有50餘年的歷史，經歷了從根瘤菌劑—細菌肥料—微生物肥料的發展演變過程。目前，市場最多見的微生物肥料主要分為微生物菌劑、複合微生物肥料和生物有機肥三類。
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