根據《財政部、稅務總局關於調整增值稅稅率的通知》（財稅[2018]32號）的規定：
「二、納稅人購進農產品，原適用11%扣除率的，扣除率調整為10%。」
憑票扣除體系下，原適用11%扣除率的情形包括：
1、自農業生產者購進自產農產品，取得免稅銷售發票或收購發票的，以買價和11%的扣除率計算抵扣進項稅額。
2、自小規模納稅人購進農產品，取得3%徵收率的專用發票，以票載金額和11%的扣除率計算抵扣進項稅額。
以上兩種情形，新扣除率的適用，均應以扣稅憑證的開具日期為準，開具日期在2018年4月30日之前的，適用11%的扣除率；開具日期在2018年5月1日之後的，適用10%的扣除率。
核定扣除體系下，原適用11%扣除率的情形包括：
1、納稅人購進農產品直接銷售，當期允許抵扣農產品增值稅進項稅額=當期銷售農產品數量/（1-損耗率）×農產品平均購買單價×11%/（1+11%）
這種情形下，新扣除率的適用，應以銷售農產品納稅義務發生時間為準，納稅義務發生在2018年4月30日之前的，適用11%的扣除率；納稅義務發生在2018年5月1日之後的，適用10%的扣除率。
2、納稅人購進農產品用於生產經營且不構成貨物實體的，當期允許抵扣農產品增值稅進項稅額=當期耗用農產品數量×農產品平均購買單價×11%/（1+11%）
這種情形下，新扣除率的適用，應以農產品耗用時間為準，農產品耗用時間在2018年4月30日之前的，適用11%的扣除率；農產品耗用時間在2018年5月1日之後的，適用10%的扣除率。
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