大量肥料投入，初期確實在很大程度上提高了蔬菜產量，增加了效益。但連續的高投入，卻不會取得連續的高產優質，甚至會很快出現土壤鹽漬化、病蟲害增多等諸多問題，土壤惡化，產量降低，陷入惡性循環。目前，壽光等主要蔬菜產區的底肥均以糞肥為主，搭配複合肥等。
1.糞肥用量要有限制
糞肥養分含量高、肥效期長，一直是底肥首選，用量巨大。然而，糞肥雖好，缺點也不少，若不合理或過量施用，導致的問題非常多，除了最普遍的糞肥不腐熟燒根問題，還有不少需要注意的地方。
一是部分糞肥中含有大量雞蝨子蟲卵或被根結線蟲汙染，造成棚內蟲害暴發；
二是部分糞肥殺菌劑、重金屬等有毒有害物質嚴重超標，造成嚴重的土壤汙染，苗子生長髮育不良甚至死棵；
三是糞肥中均含有大量鹽分，據華中農業大學測定，部分幹雞糞中食鹽含量達4.5%，破壞土壤團粒結構，降低土壤肥力。一些老農都有這樣的認識，一塊地如果衝施幾公斤的食鹽，那今年的作物長勢好，產量高，但卻透支了地力，想要再養地，就不是一兩年的事情了。
鑑於糞肥中含有較多的鹽分、蟲卵甚至重金屬等有害成分，糞肥尤其是含鹽量較高的雞鴨糞是不宜大量施用的。以幹雞糞為例，若每畝施用5000公斤，則其中就含有食鹽200公斤以上，對土壤的破壞作用是相當大的。
2.複合肥不用或少量施用
根據菜農用肥習慣，底肥施入土壤後一般還要經過高溫悶棚階段，而複合肥中的氮肥在高溫條件下極容易流失，大大降低肥效。而且，底肥中的糞肥高氮高磷，完全可以滿足蔬菜前期生長的需要。提前施入複合肥，只會造成肥料的流失，造成利用率低下，是很不划算的。
3.多種途徑增加秸稈用量
大棚土壤根本不缺肥。大量施用糞肥，利用其肥效僅是一方面，更重要的是補充土壤有機質，增加冬季棚內二氧化碳濃度，並提高土壤通透性，改良土壤。除了肥效較低外，在改良土壤、增加二氧化碳等方面，秸稈完全可以取代糞肥。與此同時，各種作物秸稈無處堆積，胡亂焚燒，成為農業發展的大問題。秸稈來源豐富，幾乎沒有成本，是取代糞肥的良好材料。除常用的玉米秸稈、稻殼等秸稈材料，近幾年蔬菜秸稈還田技術也大面積推廣使用，省工省力省成本，綜合效益十分突出。
近年來，大棚秸稈利用技術目前已經較為成熟，主要包括秸稈生物反應堆、操作行鋪秸稈、打碎後直接翻入土壤、栽培草菇、沼氣池等方法，各地菜農可選擇適宜當地的技術，充分利用各種秸稈。
4.合理補充中微量元素
中微量元素用量不足目前施肥中存在的突出問題之一，多數菜農對此缺乏正確的認識。底肥中除有機肥養分含量較全外，很少有菜農補充中微量元素肥料；追肥更不用說，清一色的高濃度氮磷鉀肥。由此造成的臍腐病、畸形果、黃葉、裂稈等缺素症近年來呈逐年上升態勢。
要知道，蔬菜都是喜鈣作物，不管是茄果類還是瓜類、豆類、葉菜，其鈣肥需求量都是很大的。如西紅柿對氮、磷、鉀、鈣、鎂5種元素的吸收比例為100：26：180：74：18，鈣的需求量僅次於鉀肥、氮肥，是磷肥的近3倍，而鎂肥需求量約為磷肥的三分之二。微量元素中，硼、鐵、鋅等是北方地區較容易出現缺乏的。
可能有菜農要問了，既然蔬菜對鈣肥需求量這麼大，也從來沒有專門用過鈣肥，蔬菜怎麼很少出現缺鈣症狀呢？原因在於北方地區多為石灰岩土壤，其中鈣含量較高，加上地下水中也富含鈣、鎂元素，使得蔬菜較少出現缺素症狀。然而，長期的蔬菜生產對鈣肥的吸收量不斷增加，勢必造成土壤逐漸缺鈣，臍腐病、黃瓜爛龍頭、裂果多等都是蔬菜缺鈣的表現。
底肥推薦方案
從上面的分析可以看出，目前底肥施用過程中的問題很多，既增加了成本，又破壞了土壤，造成了汙染，難以可持續發展。為了克服底肥施用中的各種問題，同時減少肥料投入，降低生產成本，建議菜農合理改進底肥配比。這裡，我們給出一個推薦方案，通過“減糞肥、複合肥，增秸稈、中微量元素肥”，合理調整底肥配比，菜農可根據自己棚內實際情況調整使用。
底肥方案：禽畜糞肥（幹）2000-3000公斤，秸稈2000公斤，鈣鎂磷肥100公斤（或石灰100公斤、硫酸鎂50公斤），硼砂1公斤，硫酸亞鐵、硫酸鋅各2公斤。有機肥、化肥全部撒入棚內，微肥可配成水溶液後噴灑到有機肥上，同時噴灑促進腐熟的生物菌劑，如肥力高、菌養多多等，深翻地、起壟、澆水、蓋地膜，進行高溫悶棚，持續15-20天，既可以促進糞肥腐熟，又可以殺滅土壤病原菌、蟲卵、雜草等。
注：每立方米稻殼只有90公斤左右，菜農無需購買稻殼糞，使用幹糞加粉碎秸稈的效果是一樣的，成本卻可以大大降低。
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