復旦大學創建於1905年，原名復旦公學。“復旦”二字由創始人、中國近代知名教育家馬相伯先生選定，選自《尚書大傳-虞夏傳》中“日月光華，旦復旦兮”的名句，意在自強不息，寄託當時中國知識分子自主辦學、教育強國的希望。
復旦大學經歷近百年的沿革。1917年復旦公學改名為私立復旦大學，下設文、理、商三科以及預科和中學部。1937年抗日戰爭爆發後，學校內遷重慶北碚， 並於1941年改為“國立” 。1946年學校遷回上海江灣原址。到1949年學校已設立文、理、法、商、農五院20多個系（科）。魯迅、郭沫若、鄒韜奮、老舍、竺可楨、馬寅初等著名學者曾到校演講或任教。1950年高校初步進行院系調整，復旦大學的海洋系併入山東大學；上海暨南大學的文、法、商三院，同濟大學的文、法兩院，以及浙江大學、英士大學的部分系科併入復旦大學。1952年秋全國高校院系調整，復旦大學的法學院、商學院、農學院調出，分別成立了華東政法學院、上海財經學院和瀋陽農學院；而華東地區的浙江大學、交通大學、南京大學、安徽大學、金陵大學、聖約翰大學、滬江大學、震旦大學、大同大學、光華大學、大夏大學、上海學院、中華工商專科學校、中國新聞專科學校等高等院校的文、理科有關係科併入復旦大學。二十世紀80年代以後，尤其是通過國家教育部和上海市共同建設，以及“七五”、“八五”和“九五”的重點建設，復旦大學逐步發展成為一所人文科學、社會科學、自然科學、技術科學以及管理科學在內的多科性研究型綜合大學。2000年4月27日上海醫科大學與復旦大學強強合併，成立新的復旦大學。如今的復旦大學，學科門類更為齊全，綜合實力更加強大。
復旦歷史上曾經擁有一大批學術大師和著名學者，在國內外享有盛譽。周谷城、陳望道、顏福慶、蘇步青、譚其驤、周予同、陳建功、朱東潤、胡曲園、嚴北溟、張世祿、伍蠡甫、盧鶴紱、謝希德等著名學者長期在校執教，為復旦奠定了雄厚的學術傳統和基礎。談家楨、吳浩青、谷超豪、胡和生、王迅、陳中偉、楊雄裡、楊福家、湯釗猷、顧玉東、李大潛、陳灝珠、沈自尹、聞玉梅、王威琪、陸谷孫、章培恆等一大批知名專家，仍活躍在國內外學術舞臺上，成為復旦當代學術精神的代表。建校以來複旦大學共培養了18萬餘名各類畢業生，湧現出包括于右任、邵力子、陳寅恪、竺可楨、張志讓、李嵐清等校友在內的眾多傑出人才，為國家的建設事業作出了卓越貢獻。
復旦大學現任校長為王生洪教授，黨委書記為秦紹德教授。復旦大學校訓：“博學而篤志，切問而近思”；校風：“文明、健康、團結、奮發”，學風：“刻苦、嚴謹、求實、創新”。
學校現有人文學院、外文學院、新聞學院、法學院、經濟學院、管理學院、技術科學與工程學院、生命科學學院、上海醫學院、公共衛生學院、藥學院、護理學院、信息科學與工程學院、國際關係與公共事務學院、 社會發展與公共政策學院、數學科學學院和軟件學院等17個學院(含66個系)和物理學系、化學系、高分子科學系、環境科學與工程系等4個系，68個學士學位專業，一級學科博士學位授權點22個，二級學科博士學位授權點135個(其中自設24個)，碩士學位授權點209個(其中自設38個)，並設有25個博士後科研流動站。
學校學科門類齊全，現有馬克思主義哲學、外國哲學、政治經濟學、世界經濟、金融學、產業經濟學、政治學理論、國際關係、中國古代文學、漢語言文字學、傳播學、歷史地理學、基礎數學、應用數學、運籌學與控制論、理論物理、凝聚態物理、光學、物理化學、高分子化學與物理、生態學、神經生物學、遺傳學、生理學、電路與系統、微電子學與固體電子學、人體解剖與組織胚胎學、病原生物學、病理學與病理生理學、內科學（心血管病、腎病、傳染病）、兒科學、神經病學、影像醫學與核醫學、外科學（普外科、骨外科、泌尿外科、神經外科）、眼科學、耳鼻咽喉科學、腫瘤學、中西醫結合基礎、中西醫結合臨床、社會醫學與衛生事業管理等40個國家重點學科，居全國第三位。
學校現有中國語言文學研究所、中國社會主義市場經濟研究中心、美國問題研究中心、歷史地理研究所、人口研究所、世界經濟研究所、金融研究院、數學研究所、現代物理研究所、遺傳學研究所、上海市心血管病研究所、上海市放射醫學研究所、肝癌研究所等81個研究機構，145個跨學科研究中心，有先進光子學材料與器件、專用集成電路與系統、應用表面物理、遺傳工程、醫學神經生物學等5個國家重點實驗室。還有10個教育部重點實驗室和 7個衛生部重點實驗室，8個教育部人文社會科學重點研究基地。
學校現有各類學生近44,300餘人， 其中博士生3,500人，碩士生7500餘人，普通本專科生15700餘人，外國留學生2,200餘人，成人教育本專科生8400人，網絡教育本專科生近7000人。學校擁有一支高水平的師資隊伍，現有專任教師與科研人員2,300餘人，其中教授、副教授1,350餘人，中國科學院、中國工程院院士29人，博士生導師746人，教育部“長江學者獎勵計劃”特聘教授40人、講座教授14人，“973”首席科學家6人，“國家級有突出貢獻中青年專家”31人。近幾年來，學校積極引進人才，實施教育部“長江學者獎勵計劃”，湧現出一批優秀的中青年教師，優化了師資隊伍結構。學校還擁有中山、華山等9個附屬醫院，集醫療服務、臨床教學與科研工作於一體。醫院醫療設備先進、技術力量雄厚，有900多人具有正、副高級職稱，為臨床教學創造了良好的教學條件。
日月光華，旦復旦兮。在國家教育部和上海市政府的重點投資下，復旦這所百年名校正力爭建設成為一所立足上海、服務全國、國際一流的高水平、研究型的世界一流綜合性大學，為人類文明進步，不斷探索教育、科技創新和制度創新成果。
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