基於CRISPR-Cas19的SARS-CoV-2僅45分鐘的快速診斷技術

之前的疾病大流行告訴我們,快速且易獲取的檢測方法對於實現有效的公共衛生響應很重要。然而,

目前的SARS-CoV-2檢測方法往往需要幾小時甚至幾天才能出結果


2020年4月16日,加州大學舊金山分校的邱華彥和Mammoth Biosciences公司的Janice S. Chen在Nature Biotechnology雜誌上發表了文章CRISPR–Cas12-based detection of SARS-CoV-2,報道了一種基於CRISPR的診斷工具可以快速檢測出SARS-CoV-2。這一診斷工具大概需要45分鐘就能給出結果,準確性與傳統的RT-PCR檢測相當。


基於CRISPR-Cas19的SARS-CoV-2僅45分鐘的快速診斷技術

研究人員報道了一種基於CRISPR–Cas12的測試方法,可以從COVID-19患者呼吸道拭子提取的RNA中鑑定出SARS-CoV-2。這個測試名為"SARS-CoV-2的DNA內切酶靶向CRISPR反式報告系統"(DETECTR)。測試需要先取得樣本RNA,然後將其逆轉錄到DNA中,再通過一種名為等溫擴增的技術進行擴增。之後,SARS-CoV-2包膜(envelope,E)和核衣殼(nucleocapsid,N)的基因序列就可以被CRISPR–Cas12檢測到,CRISPR–Cas12會切割確認病毒存在的報告分子。作者利用36名COVID-19患者和42名其他呼吸道疾病患者的臨床樣本測試了該系統。與美國疾病預防與控制中心使用的RT-PCR檢測相比,該測試的陽性預測符合率為95%,陰性預測符合率為100%。


RT-PCR的檢測一般要等幾個小時,還需要使用特殊設備、進行冷熱循環;與之相比,DETECTR只有兩個固定的操作溫度,大約45分鐘後,就能像家用驗孕測試一樣,在可視化讀出條上讀取結果。


原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41587-020-0513-4.pdf


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