新冠病毒被命名為SARS-CoV-2是真的嗎?

網傳消息:新冠病毒被命名為SARS-CoV-2。

鑑定結果:屬實

新冠病毒被命名為SARS-CoV-2是真的嗎?


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權威解讀:

  • 對病毒進行命名的機構,也就是國際病毒分類委員會(International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV),其下屬的冠狀病毒研究組(Coronavirus Study Group,CSG)在剛發表於BioRxiv上的預印本文章,將WHO暫時命名的新型冠狀病毒2019-nCoV正式命名為SARS-CoV2。
  • 國際病毒分類委員會(ICTV)是病毒分類的權威機構,是世界各地進行病毒相關科研所依據的標準命名。

查證者:病原生物學博士 Vigorous Cooler


延伸閱讀:

先上張圖:

新冠病毒被命名為SARS-CoV-2是真的嗎?


ICTV對冠狀病毒的分類

ICTV的官網截圖並不清晰,我將冠狀病毒相關信息摘出如下:

新冠病毒被命名為SARS-CoV-2是真的嗎?


官網截圖1

可以看到,冠狀病毒的上級分類是目(order),下級有科(family)、屬(genus)、種(species)。

新冠病毒被命名為SARS-CoV-2是真的嗎?


官網截圖2

而現在討論的SARS-CoV2是一個比還要小的概念。

來自國際病毒分類委員會(ICTV)冠狀病毒研究組(Coronavirus Study Group,CSG)發表在冷泉港預印本雜誌bioRxiv上 的一篇文章對現在正在流行的新型冠狀病毒及其引起的疾病進行了闡述。

Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus – The species and its viruses, a statement of the Coronavirus Study Group. doi:

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新冠病毒被命名為SARS-CoV-2是真的嗎?


冷泉港預印本雜誌

ICTV的冠狀病毒研究組(CSG)是制定冠狀病毒科病毒分類名稱的官方機構。通過系統進化分析,CSG認為新冠狀病毒是SARS冠狀病毒(SARS-CoV)的姊妹病毒,同屬於SARS相關冠狀病毒(SARSr

-CoV)這個的範圍之下。並且將之正式命名為SARS-CoV-2。為了進一步促進交流,CSG還建議後續分離的病毒毒株(isolate)用這樣的命名方式:SARS-CoV-2/Isolate/Host/Date/Location,也就是SARS-CoV-2/分離株/宿主/時間/地點,按照這個格式,如果2020-0212日在武漢一位病人中分離到一株病毒,就可以稱之為SARS-CoV-2/Isolate X/human/20200212/Wuhan。

而之前,CSG這個小組制定冠狀病毒內部亞科、屬、亞屬和種的分類依據是氨基酸殘基的重複替換(PPD)和佔所比較蛋白質中氨基酸的百分比(PUD),也就是說,對於種來說,替換的氨基酸佔比在2.1%~2.3%之內的算同一個種。

新冠病毒被命名為SARS-CoV-2是真的嗎?


冠狀病毒科內各此分類劃分標準

根據分離到不同毒株的信息進行物種成對距離劃分,其實可以看到,SARS-CoV下不同毒株的差異並不比豬流行性腹瀉病毒(PEDV)、中東呼吸綜合徵病毒(MERS-CoV)和傳染性支氣管炎病毒(IBV,針對禽類的冠狀病毒)大。而再對SARSr-CoV進行分類,可以看到SARS-CoV2與SARS-CoV相互之間的差異又比較明顯,所以,ICTV-CSG認為“新型冠狀病毒”屬於SARS樣冠狀病毒種,但是與SARS-CoV又不一樣,屬於另一個毒株。

新冠病毒被命名為SARS-CoV-2是真的嗎?


物種成對距離劃分

所以,ICTV-CSG根據現有的序列分析,認為“新冠狀病毒”並非一個“新病毒”,而只是改頭換面變了一些氨基酸捲土重來的毒株,並不能作為一個新的“種”來定義。

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新冠病毒的分析

CSG為了大家便於理解,還專門製作了一個冠狀病毒分類與人在分類學上的概念的類比,也就是說,在這次的SARS樣冠狀病毒下不同的病毒株,就類似於同屬於人類的不同的人一樣。

新冠病毒被命名為SARS-CoV-2是真的嗎?


病毒分類與人的類比

作為病毒學研究人員,我個人是贊同這樣的分類的。

前期報道有人提到就像登革病毒分四個型別,DENV-1,DENV-2,DENV-3和DENV-4。這次在人間又一次出現的新型冠狀病毒和SARS-CoV的類似性和差異性,表明了是其先祖的又一分支在人間又一次成功傳播。所以從分類學的角度是非常容易理解ICTV-CSG這樣的命名。但是後續是不是會有其他因素影響這樣的命名不好下結論。


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