引起僵苗的原因很多，有栽培原因，也有土壤原因，概括起來主要有四個方面 : 一、有可能是插秧過深，一般插秧深度不超過2釐米，插深了，由於土溫低，根系發育遲緩，導致返青慢，地上部分遲滯生長，在感官上覺得水稻苗半死不活的。
二、有可能是水中含有有毒物質。如果水耙地後，擱置時間過長，加上天氣溫度高，水質變壞，產生的硫化氫等有毒有害物質，使稻苗產生中毒症狀，生長收到影響，水稻苗表現為生長緩慢。三、有可能是土壤缺鋅原因。由於農民在水稻生產中，習慣於使用氮磷鉀等大量肥料，不瞭解水稻生產中還需要鋅肥，一般情況下，水稻缺鋅會導致生長遲滯現象這就是老百姓所說的僵化苗。四、有可能是藥害導致僵苗。在插秧前施用農思它、丁草胺等封閉除草劑藥量過大，水稻生長會受到嚴重抑制，出現僵苗。
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